Tres años después, con un plantel mayoritariamente de jóvenes surgidos de las divisiones inferiores, obtiene el tercer subcampeonato de fútbol local de su historia en el Torneo Clausura 2006. El equipo titular lo integran: Bossio; Graieb, Gioda, Romero y Velazquez; Aguirre, Agustín Pelletieri, Archubi y Leto; Biglieri y Cristian Fabbiani, equipacion real madrid siendo el D.T. En 2003 finalizaba las obras de su estadio de fútbol.